如何可以更全面地了解10x单细胞ATAC-seq?

2025-10-19 13:26:30

1、10x单细胞ATAC-seq实验流程

首先,将转座酶加入制备好的单细胞核悬液进行反应。

随后,利用8通道的微流体双十字交叉系统将含Barcode的Gel Beads、细胞核和酶的混合物、油三者结合形成GEMs。在GEMs中,凝胶珠溶解释放大量barcode序列,DNA延伸带上barcode序列,并进行线性扩增。

最后,进行illumina的文库构建。

如何可以更全面地了解10x单细胞ATAC-seq?

2、10x单细胞ATAC-seq可以有哪些方向的应用

从具体分析内容来讲,单细胞ATAT测序:

●  可在单细胞水平揭示细胞核内染色质可接近性的差异;

●  可鉴定细胞类型特异的转录因子,深入研究转录调控网络;

●  可预测转录因子结合位点,推测染色质调控活性。

从生物学研究大方向分,单细胞ATAC测序:

●  可应用于干细胞或发育生物学的研究,绘制驱动细胞分化的调控网络;

●  适用于免疫学研究,可揭示T细胞激活、分化等过程的表观调控机制;

●  可挖掘用于肿瘤亚型鉴定的新型分子标记,研究肿瘤发生相关的重要通路;

●  可应用于神经科学,鉴定复杂的神经细胞亚型,探究神经相关疾病的分子机制。

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