外泌体数据库你知道多少?
近年来,外泌体有多火就不用小医多说了吧。在肿瘤等疾病的基础研究、转化应用和诊断治疗中展现出巨大潜力,那研究热度真的是蹭蹭往上涨。当然在国自然项目中,外泌体的中标项目及资助金额也是飙升,成为国自然数一数二的热点之一。
也许你在担心自己的课题不适合做外泌体,莫慌!实际上外泌体是一个非常特殊的对象,它并不是终极的一个分子或蛋白,它是一个单位,而这一单位是细胞与细胞之间沟通方式的最主要形式,因此你可以想象,几乎所有生物医药研究领域,你都可以全新的,从外泌体的角度进行挖掘!
今天就给大家介绍几个外泌体研究中常用的数据库!
工具/原料
外泌体研究中常用的数据库
EVpedia-外体蛋白质组、转录组和脂质体数据库
EVpedia是由韩国项浦大学创建的一个完整而全面的蛋白质组、转录组和脂肪体数据库,其来源于古菌、细菌和真核生物,包括人类。ExoCarta外体蛋白质、RNA和脂质数据库
摘要部分看完大概知道文章找了些结直肠癌中差异的上百了lncRNA,后来从中缩小到了8个lncRNA,然后弄了一个基于SVM的风险分类模型来区分早期结直肠癌中的高风险病人,然后还做了通路富集分析啦。Vesiclepedia --外体蛋白质、RNA和脂质数据库
Vesiclepedia,一个胞外囊泡分子数据(脂质、RNA和蛋白质)的手工检索工具库,目前包含来自于过去一些年份文献中发表的341个独立研究的35264个蛋白,18718个mRNA,1772个miRNA、342个脂质条目,还可以根据物种、囊泡、分子和样品类型浏览和检索。EMBL-EBI
欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)拥有世界上最全面的免费和最新的分子数据资源.外基-外体圆环RNA数据库、INcRNA和mRNA
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